Perodua Myvi 配備過三種傳動系統：MT（棍波）、AT（自動波）及 CVT（無段變速波箱）。早期部分型號配備 MT 或 AT 波箱。例如 2018 至 2020 年部分版本採用 MT 或 AT 波箱。不過，自 2022 年起，小改款 Myvi 全線已轉用 D-CVT（Direct-Shift Continuously Variable Transmission）波箱。D-CVT 波箱帶來更順暢、更線性的加速感受、更佳耗油表現，以及更爽快的動力輸出。2022 - 2023 Perodua Myvi 1.3 G、1.5 X、1.5 H 及 1.5 AV 等型號均採用此類傳動系統。不同波箱各有特點，MT 波箱提供較強駕駛掌控感，AT 操作簡易，而 CVT 則在順暢度及耗油量方面表現出色。消費者可按自身需要選擇。
