燃料電池同柴油引擎喺動力原理、能源效率同環保表現方面都有明顯分別。燃料電池透過氫同氧之間嘅化學反應直接發電，用嚟推動摩打，能源轉換效率超過30%，遠高於柴油引擎嘅22%-24%。而且運作期間只會排放水，做到零污染。相反，柴油引擎依靠燃燒柴油取得機械能，並需要複雜嘅傳動系統去驅動車輛。雖然柴油引擎有加油方便同續航距離長嘅優點，但會產生廢氣排放。技術上，燃料電池採用靜態能源轉換，因此噪音同震動較低，短時間過載能力可達200%。不過，燃料電池亦面對製造成本高、加氫基建不足等挑戰。柴油引擎就勝在技術成熟、維修網絡廣泛，但效率受卡諾循環限制。目前，Toyota Mirai 等燃料電池車只需3分鐘加氫，就可以達到600公里續航；而柴油車喺長途運輸領域仍然佔主導地位。兩種技術喺能源結構、應用場景同技術成熟度方面互相補足。
