波箱最常見嘅故障係漏油，主要表現為波箱殼體或油底殼滲油，通常由油封老化、殼體鑄造氣孔，或者外力撞擊造成。第二常見嘅問題係轉波異常，包括自動波入檔反應遲鈍、轉波頓挫，或者棍波揀檔困難。呢啲問題通常同離合器片燒蝕、閥體卡滯，或者液壓系統故障有關。波箱打滑亦相當常見，特徵係引擎轉速上升，但車輛加速未有相應提升，主要原因係離合器片磨損或者波箱油受污染。異常噪音亦經常出現；軸承或齒輪磨損會產生隨轉速變化嘅金屬摩擦聲，而同步器失效就會喺轉波時出現打齒聲。預防性保養尤其重要。建議每 50,000 至 60,000 公里更換專用波箱油，定期檢查油位同油質，並避免急加速或長時間半離合。只要發現漏油或異常噪音，就應該即時維修；更換小型油封約需 200-500 ringgit，但若延誤處理，可能導致總成維修費用高達數千 ringgit。自動波對油品品質要求嚴格，必須使用廠方指定配方，因為用錯油會加速閥體磨損。
