混能車嘅保養成本唔一定高過燃油車；實際開支取決於車輛結構、保養策略同品牌政策。雖然混能車增加咗電池同摩打等部件嘅保養項目，例如每年約 300-800 ringgit 嘅電池檢查費，以及每 40,000 公里以 420 ringgit 更換摩打冷卻液，但由於電動系統輔助令引擎工作量減少，保養間隔可延長至 12,000-15,000 公里，並令機油消耗成本降低 28%。再生煞車系統可將煞車皮壽命延長至 400,000 公里，遠高於燃油車嘅 40,000 公里，長遠慳費效果明顯。唔同混能類型之間成本差異明顯：HEVs 每年需 2,600-3,500 ringgit（適合每年行駛 15,000 公里），PHEVs 約 3,800-5,000 ringgit（充電頻率會令成本相差 30%），REEVs 則約 4,200-5,500 ringgit。合理利用廠方保養（例如電池終身保養）同免費檢查服務，可進一步優化開支；例如自行更換冷氣隔可慳 50%，自行更換水撥膠可慳 60%。整體而言，憑藉耗油量優勢（慳油 30%-50%）同部件耐用度，混能車嘅長期保養成本往往低過同級燃油車。不過，仍需為 60,000 公里大保養預留 2,500 ringgit，並嚴格跟從高壓線束密封性等特別檢查。
