MT 波箱是 Manual Transmission 的縮寫。其核心特點是駕駛者需要透過操作離合器及波棍，直接控制齒輪咬合，從而改變傳動比。這類波箱結構簡單、製造成本低，傳動效率超過 95%，可明顯降低耗油量，特別適合重視經濟性的消費者。由於機械磨損較少、保養成本低，MT 波箱在入門車型及商用車上仍佔有一定市場。其駕駛優勢包括更直接的加速反應，讓駕駛者可透過自行選波適應不同路況。例如上斜時提早降波，以維持扭力輸出。這種操作彈性亦吸引追求駕駛參與感的車迷。不過，在擠塞交通中頻繁踩離合器及轉波會增加駕駛者負擔，這亦解釋了為何部分城市用戶偏好自動波。目前市場上大部分 MT 波箱設有 5 至 6 個前進波，隨着技術進步，轉波行程及離合器腳踏力度已獲優化，提升駕駛舒適性。值得留意的是，儘管自動波日漸普及，MT 波箱在駕駛教學及特定車輛類別中仍不可或缺，例如性能車或入門 Pickup。
